Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IKZF1Q13422 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IKZF1Q13422 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms