Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPRL3Q12980 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms