Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCAPQ12770 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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