Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB38P57729 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB38P57729 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms