Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERFP50548 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms