Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCLMP48507 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCLMP48507 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCLMP48507 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCLMP48507 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms