Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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