Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HOXA5P20719 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms