Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACADSP16219 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSP16219 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSP16219 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSP16219 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACADSP16219 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms