Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms