Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SNX13Q9Y5W8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX13Q9Y5W8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms