Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms