Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBM4Q9BWF3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms