Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDHD3Q9BSH5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDHD3Q9BSH5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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