Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CAVIN3Q969G5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms