Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
LINC00612Q8N6U2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
LINC00612Q8N6U2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms