Protein–RNA interactions for Protein: Q86U90

YRDC, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YRDCQ86U90 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YRDCQ86U90 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms