Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USP43Q70EL4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms