Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KRT80Q6KB66 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms