Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
KRTAP21-1Q3LI58 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms