Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCK2Q16822 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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