Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3AQ13472 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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