Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
XRCC4Q13426 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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