Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBBP4Q09028 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms