Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AP2S1P53680 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms