Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ME1P48163 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ME1P48163 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ME1P48163 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ME1P48163 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms