Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GCAP28676 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GCAP28676 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GCAP28676 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GCAP28676 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms