Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB9P28065 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms