Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRF1P14222 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRF1P14222 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms