Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIPSNAP2O75323 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms