Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC4-APOC2K7ER74 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms