Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM15Q9C019 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms