Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCNX1Q96RV3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCNX1Q96RV3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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