Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.837e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)9.84□□□□□ -0.837e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.847e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SETDB1-208ENST00000459773 791 ntTSL 39.82□□□□□ -0.847e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAOK1-205ENST00000583121 526 ntTSL 39.81□□□□□ -0.847e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ST5-250ENST00000533081 551 ntTSL 49.78□□□□□ -0.847e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZSCAN9-202ENST00000425468 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP4R1-201ENST00000285124 2917 ntTSL 59.74□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDC42SE1-202ENST00000439374 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.857e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD21-AS1-202ENST00000523626 555 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.867e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.867e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.867e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-204ENST00000422355 562 ntTSL 29.65□□□□□ -0.867e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-214ENST00000481284 2851 ntTSL 29.65□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 49.64□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-224ENST00000497927 580 ntTSL 49.64□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBFOX2-202ENST00000359369 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-221ENST00000552642 526 ntTSL 49.63□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 XPNPEP2-202ENST00000371106 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-204ENST00000541475 6725 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EPAS1-209ENST00000475822 551 ntTSL 49.56□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC106869.1-204ENST00000450550 393 ntTSL 59.55□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZSCAN9-201ENST00000252207 1621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP4R1-222ENST00000582594 2982 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ANAPC1-202ENST00000427997 5047 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.887e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.897e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-206ENST00000433961 2759 ntTSL 29.5□□□□□ -0.897e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-213ENST00000553325 976 ntTSL 29.42□□□□□ -0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 59.42□□□□□ -0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 59.42□□□□□ -0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR1-210ENST00000458113 3490 ntTSL 29.4□□□□□ -0.97e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LPP-213ENST00000471917 998 ntTSL 39.39□□□□□ -0.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-211ENST00000492086 662 ntTSL 39.38□□□□□ -0.917e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-209ENST00000547275 564 ntTSL 49.27□□□□□ -0.937e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.937e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-208ENST00000612339 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.947e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSMCE2-203ENST00000517532 841 ntTSL 59.18□□□□□ -0.947e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEK6-204ENST00000373603 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.947e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.947e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.957e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.957e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CREBRF-204ENST00000520464 5163 ntTSL 29.1□□□□□ -0.957e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP002360.1-205ENST00000531785 608 ntTSL 39.09□□□□□ -0.957e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP002360.1-204ENST00000529331 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF343-201ENST00000278772 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD21-AS1-205ENST00000530261 910 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-205ENST00000542140 1908 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.967e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-227ENST00000622057 706 ntTSL 59.01□□□□□ -0.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PTPN12-216ENST00000523952 500 ntTSL 49□□□□□ -0.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-205ENST00000472750 3504 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.977e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.987e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.987e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZSCAN9-204ENST00000527436 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP4R1-213ENST00000579609 565 ntTSL 38.86□□□□□ -0.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.997e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-229ENST00000475971 4038 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -17e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.017e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.017e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDC42SE1-204ENST00000483763 2379 ntTSL 1 (best)8.72□□□□□ -1.017e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 POLR3E-213ENST00000565117 1549 ntTSL 28.7□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LRRFIP1-208ENST00000468950 815 ntTSL 58.66□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FOXP1-213ENST00000493010 544 ntTSL 48.65□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 58.6□□□□□ -1.037e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.047e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAUS8-208ENST00000601564 826 ntTSL 38.52□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LINC01138-210ENST00000640832 1709 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZKSCAN8-204ENST00000606198 2057 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.46□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-202ENST00000423695 1232 ntTSL 28.45□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BACH1-206ENST00000451655 777 ntTSL 38.44□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SNRNP70-208ENST00000599687 563 ntTSL 28.43□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-222ENST00000620505 657 ntTSL 58.43□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC106869.1-203ENST00000419035 1892 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MARCH6-210ENST00000511802 4734 ntTSL 28.4□□□□□ -1.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCOR1-203ENST00000395849 3419 ntTSL 28.35□□□□□ -1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAP31-205ENST00000430088 570 ntTSL 28.31□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LPP-202ENST00000415906 888 ntTSL 28.3□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EXOC7-220ENST00000607838 3353 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ALS2-204ENST00000439495 3242 ntTSL 28.29□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SETDB1-213ENST00000498193 3854 ntTSL 28.26□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CCT5-204ENST00000503454 762 ntTSL 38.24□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.097e-6■■■■■ 27.5
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