Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP3S1Q92572 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms