Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC93Q567U6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms