Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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COL24A1Q17RW2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COL24A1Q17RW2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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