Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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