Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBX3Q13185 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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