Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSTF3Q12996 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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