Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms