Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FMODQ06828 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FMODQ06828 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FMODQ06828 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms