Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNA2P26232 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CTNNA2P26232 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms