Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTN1P12814 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms