Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOLGA6L9A6NEM1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOLGA6L9A6NEM1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms