Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYTH4Q9UIA0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms