Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms