Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PFDN4Q9NQP4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms