Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SIRT1Q96EB6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms