Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TNPO1Q92973 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNPO1Q92973 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms